Da li koristiš program dobijen uz programator ? Ako ga koristiš, verovatno si podesio sve parametre za dati čip i ako je tako, a on i dalje ne vidi čip (procesor) onda ti nešto nije u redu sa samim programatorom ili kontaktima.
Imao sam sličnu zjbnciju i problem se rešio promenom USB porta i novom instalacijom softvera !?
Ako već nisi, onda skini sa Atmelovog sajta data šit i proveri načine programiranja, uslove i parametre.
...Da li uopšte vidi tj prijavljuje bilo šta kad ih staviš?